Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms