Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cracr2bQ80ZJ8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms