Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NanogQ80Z64 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NanogQ80Z64 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NanogQ80Z64 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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NanogQ80Z64 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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NanogQ80Z64 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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NanogQ80Z64 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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NanogQ80Z64 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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NanogQ80Z64 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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NanogQ80Z64 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NanogQ80Z64 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NanogQ80Z64 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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