Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk9Q80W65 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcsk9Q80W65 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms