Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Avl9Q80U56 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms