Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shq1Q7TMX5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shq1Q7TMX5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Shq1Q7TMX5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Shq1Q7TMX5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Shq1Q7TMX5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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