Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms