Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trpv1Q704Y3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpv1Q704Y3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpv1Q704Y3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpv1Q704Y3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpv1Q704Y3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpv1Q704Y3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpv1Q704Y3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpv1Q704Y3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpv1Q704Y3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpv1Q704Y3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpv1Q704Y3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpv1Q704Y3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpv1Q704Y3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpv1Q704Y3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpv1Q704Y3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpv1Q704Y3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpv1Q704Y3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpv1Q704Y3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpv1Q704Y3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpv1Q704Y3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpv1Q704Y3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpv1Q704Y3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpv1Q704Y3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms