Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY3

Rps27l, 40S ribosomal protein S27-like, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27lQ6ZWY3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27lQ6ZWY3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27lQ6ZWY3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms