Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms