Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54bQ6PFE3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms