Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg2aQ6P4T0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms