Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Slx4Q6P1D7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx4Q6P1D7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms