Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac4Q6NZM9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac4Q6NZM9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac4Q6NZM9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac4Q6NZM9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac4Q6NZM9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac4Q6NZM9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac4Q6NZM9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac4Q6NZM9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac4Q6NZM9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms