Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SphkapQ6NSW3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SphkapQ6NSW3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms