Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms