Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt39Q6IFX4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt39Q6IFX4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms