Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt40Q6IFX3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt40Q6IFX3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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