Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms