Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hist2h2aa1Q6GSS7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hist2h2aa1Q6GSS7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms