Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms