Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrcc1Q69ZB0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrcc1Q69ZB0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms