Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk13Q69ZA1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms