Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3ipQ68EF0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms