Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Polr2kQ63871 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms