Protein–RNA interactions for Protein: Q62458

Gm20809, (clone BALB14N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20809Q62458 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20809Q62458 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20809Q62458 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20809Q62458 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20809Q62458 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20809Q62458 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20809Q62458 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gm20809Q62458 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gm20809Q62458 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gm20809Q62458 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20809Q62458 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Gm20809Q62458 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20809Q62458 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20809Q62458 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20809Q62458 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Gm20809Q62458 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Gm20809Q62458 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Gm20809Q62458 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Gm20809Q62458 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gm20809Q62458 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gm20809Q62458 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gm20809Q62458 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Gm20809Q62458 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Gm20809Q62458 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20809Q62458 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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