Protein–RNA interactions for Protein: Q62296

Tead4, Transcriptional enhancer factor TEF-3, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tead4Q62296 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tead4Q62296 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tead4Q62296 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms