Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttf1Q62187 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ttf1Q62187 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ttf1Q62187 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ttf1Q62187 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms