Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd1Q62101 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms