Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms