Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot7Q60809 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Cnot7Q60809 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot7Q60809 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms