Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atf3Q60765 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms