Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcf4Q60722 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcf4Q60722 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms