Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arcn1Q5XJY5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arcn1Q5XJY5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arcn1Q5XJY5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arcn1Q5XJY5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arcn1Q5XJY5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Arcn1Q5XJY5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Arcn1Q5XJY5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arcn1Q5XJY5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Arcn1Q5XJY5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arcn1Q5XJY5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arcn1Q5XJY5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arcn1Q5XJY5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arcn1Q5XJY5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arcn1Q5XJY5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arcn1Q5XJY5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arcn1Q5XJY5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms