Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C1

Gprasp1, G-protein coupled receptor-associated sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gprasp1Q5U4C1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gprasp1Q5U4C1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms