Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc42Q5SV66 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc42Q5SV66 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms