Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Sco1Q5SUC9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Sco1Q5SUC9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Sco1Q5SUC9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Sco1Q5SUC9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Sco1Q5SUC9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Sco1Q5SUC9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Sco1Q5SUC9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Sco1Q5SUC9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sco1Q5SUC9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms