Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sft2d1Q5SSN7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms