Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms