Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scarf1Q5ND28 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scarf1Q5ND28 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scarf1Q5ND28 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scarf1Q5ND28 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Scarf1Q5ND28 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scarf1Q5ND28 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms