Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim41Q5NCC3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms