Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm12253Q5NC48 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm12253Q5NC48 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm12253Q5NC48 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm12253Q5NC48 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm12253Q5NC48 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm12253Q5NC48 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm12253Q5NC48 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm12253Q5NC48 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm12253Q5NC48 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gm12253Q5NC48 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm12253Q5NC48 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm12253Q5NC48 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gm12253Q5NC48 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gm12253Q5NC48 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gm12253Q5NC48 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm12253Q5NC48 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm12253Q5NC48 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm12253Q5NC48 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm12253Q5NC48 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm12253Q5NC48 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm12253Q5NC48 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm12253Q5NC48 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm12253Q5NC48 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm12253Q5NC48 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm12253Q5NC48 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm12253Q5NC48 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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