Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

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Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Usp28Q5I043 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp28Q5I043 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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