Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnni3kQ5GIG6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms