Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CenpjQ569L8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpjQ569L8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpjQ569L8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpjQ569L8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpjQ569L8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpjQ569L8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpjQ569L8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpjQ569L8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpjQ569L8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpjQ569L8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpjQ569L8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpjQ569L8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpjQ569L8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpjQ569L8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpjQ569L8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpjQ569L8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpjQ569L8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenpjQ569L8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CenpjQ569L8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenpjQ569L8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms