Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prune2Q52KR3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms