Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms