Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3lQ4KL14 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms