Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2W7

4930518I15Rik, RIKEN cDNA 4930518I15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930518I15RikQ3V2W7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930518I15RikQ3V2W7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms