Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Esf1Q3V1V3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Esf1Q3V1V3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.5 ms